ఫాస్ఫోరైలేషన్, హిస్టోన్ H2A క్రోమాటిన్‌తో అనుసంధానం కావడాన్ని ప్రోత్సహించడం ద్వారా అరాబిడోప్సిస్‌లోని ప్రధాన పెరుగుదల నియంత్రకం DELLAను క్రియాశీలం చేస్తుంది.

డెల్లా ప్రోటీన్లు సంరక్షించబడిన మాస్టర్పెరుగుదల నియంత్రకాలుఅంతర్గత మరియు పర్యావరణ సంకేతాలకు ప్రతిస్పందనగా మొక్కల అభివృద్ధిని నియంత్రించడంలో ఇవి కీలక పాత్ర పోషిస్తాయి. డెల్లా (DELLA) ఒక ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ రెగ్యులేటర్‌గా పనిచేస్తుంది మరియు దాని GRAS డొమైన్ ద్వారా ట్రాన్స్క్రిప్షన్ ఫ్యాక్టర్లు (TFs) మరియు హిస్టోన్ H2A లకు బంధించడం ద్వారా టార్గెట్ ప్రమోటర్లకు చేర్చబడుతుంది. ఇటీవలి అధ్యయనాలు డెల్లా స్థిరత్వం రెండు విధానాల ద్వారా పోస్ట్-ట్రాన్స్‌లేషనల్‌గా నియంత్రించబడుతుందని చూపించాయి: ఒకటి, ఫైటోహార్మోన్ గిబ్బరెల్లిన్ ద్వారా ప్రేరేపించబడిన పాలియుబిక్విటినేషన్, ఇది దాని వేగవంతమైన క్షీణతకు దారితీస్తుంది; రెండవది, దాని సంచయాన్ని పెంచడానికి చిన్న యుబిక్విటిన్-వంటి మాడిఫైయర్‌ల (SUMO) సంయోగం. అదనంగా, డెల్లా చర్య రెండు విభిన్న గ్లైకోసైలేషన్‌ల ద్వారా డైనమిక్‌గా నియంత్రించబడుతుంది: డెల్లా-TF పరస్పర చర్య O-ఫ్యూకోసైలేషన్ ద్వారా మెరుగుపరచబడుతుంది, కానీ O-లింక్డ్ N-ఎసిటైల్‌గ్లూకోసమైన్ (O-GlcNAc) మాడిఫికేషన్ ద్వారా నిరోధించబడుతుంది. అయితే, DELLA ఫాస్ఫోరైలేషన్ పాత్ర అస్పష్టంగానే ఉంది, ఎందుకంటే గత అధ్యయనాలు పరస్పర విరుద్ధమైన ఫలితాలను చూపించాయి; కొన్ని అధ్యయనాలు ఫాస్ఫోరైలేషన్ DELLA క్షీణతను ప్రోత్సహిస్తుందని లేదా తగ్గిస్తుందని చూపగా, మరికొన్ని ఫాస్ఫోరైలేషన్ దాని స్థిరత్వాన్ని ప్రభావితం చేయదని చూపించాయి. ఇక్కడ, మేము REPRESSORలో ఫాస్ఫోరైలేషన్ ప్రదేశాలను గుర్తిస్తాము.ga1-3అరాబిడోప్సిస్ థాలియానా నుండి మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ విశ్లేషణ ద్వారా శుద్ధి చేయబడిన (RGA, AtDELLA) రెండు RGA పెప్టైడ్‌ల యొక్క పాలీఎస్ మరియు పాలీఎస్/టి ప్రాంతాల వద్ద జరిగే ఫాస్ఫోరైలేషన్, H2A బంధనాన్ని మరియు మెరుగైన RGA కార్యాచరణను ప్రోత్సహిస్తుందని మా అధ్యయనం చూపిస్తుంది. లక్ష్య ప్రమోటర్లతో RGA యొక్క అనుబంధం కూడా గమనించబడింది. ముఖ్యంగా, ఫాస్ఫోరైలేషన్ RGA-TF పరస్పర చర్యలను లేదా RGA స్థిరత్వాన్ని ప్రభావితం చేయదు. ఫాస్ఫోరైలేషన్ ఏ అణు యంత్రాంగం ద్వారా DELLA కార్యాచరణను ప్రేరేపిస్తుందో మా అధ్యయనం వెల్లడిస్తుంది.
DELLA పనితీరును నియంత్రించడంలో ఫాస్ఫోరైలేషన్ పాత్రను స్పష్టం చేయడానికి, జీవకణాలలో (in vivo) DELLA ఫాస్ఫోరైలేషన్ ప్రదేశాలను గుర్తించి, మొక్కలలో క్రియాత్మక విశ్లేషణలు చేయడం చాలా కీలకం. మొక్కల సారాలను అఫినిటీ ప్యూరిఫికేషన్ చేసి, ఆ తర్వాత MS/MS విశ్లేషణ చేయడం ద్వారా, మేము RGAలో అనేక ఫాస్ఫోసైట్‌లను గుర్తించాము. GA లోపం ఉన్న పరిస్థితులలో, RHA ఫాస్ఫోరైలేషన్ పెరుగుతుంది, కానీ ఈ ఫాస్ఫోరైలేషన్ దాని స్థిరత్వాన్ని ప్రభావితం చేయదు. ముఖ్యంగా, కో-IP మరియు ChIP-qPCR పరీక్షలు RGA యొక్క PolyS/T ప్రాంతంలో జరిగే ఫాస్ఫోరైలేషన్, H2Aతో దాని పరస్పర చర్యను మరియు లక్ష్య ప్రమోటర్లతో దాని అనుబంధాన్ని ప్రోత్సహిస్తుందని వెల్లడించాయి. తద్వారా, ఫాస్ఫోరైలేషన్ RGA పనితీరును ప్రేరేపించే యంత్రాంగాన్ని బహిర్గతం చేశాయి.
LHR1 సబ్‌డొమైన్ మరియు TFల పరస్పర చర్య ద్వారా RGA లక్ష్య క్రోమాటిన్‌కు చేర్చబడుతుంది, ఆపై దాని PolyS/T ప్రాంతం మరియు PFYRE సబ్‌డొమైన్ ద్వారా H2Aకు బంధించబడి, RGAను స్థిరీకరించడానికి H2A-RGA-TF సంక్లిష్టాన్ని ఏర్పరుస్తుంది. DELLA డొమైన్ మరియు GRAS డొమైన్ మధ్య ఉన్న PolyS/T ప్రాంతంలో, గుర్తించబడని ఒక కైనేస్ ద్వారా Pep 2 యొక్క ఫాస్ఫోరైలేషన్, RGA-H2A బంధాన్ని పెంచుతుంది. rgam2A మ్యూటెంట్ ప్రోటీన్ RGA ఫాస్ఫోరైలేషన్‌ను రద్దు చేస్తుంది మరియు H2A బంధానికి ఆటంకం కలిగించడానికి వేరొక ప్రోటీన్ ఆకృతిని పొందుతుంది. దీని ఫలితంగా తాత్కాలిక TF-rgam2A పరస్పర చర్యలు అస్థిరపడతాయి మరియు rgam2A లక్ష్య క్రోమాటిన్ నుండి విడిపోతుంది. ఈ పటం RGA-మధ్యవర్తిత్వ ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ నిరోధాన్ని మాత్రమే వర్ణిస్తుంది. RGA-మధ్యవర్తిత్వ ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ క్రియాశీలతకు కూడా ఇలాంటి నమూనానే వివరించవచ్చు, అయితే H2A-RGA-TF సంక్లిష్టం లక్ష్య జన్యు ట్రాన్స్క్రిప్షన్‌ను ప్రోత్సహిస్తుంది మరియు rgam2A యొక్క డీఫాస్ఫోరైలేషన్ ట్రాన్స్క్రిప్షన్‌ను తగ్గిస్తుంది. పటం హువాంగ్ మరియు ఇతరులు21 నుండి సవరించబడింది.
అన్ని పరిమాణాత్మక డేటాను ఎక్సెల్ ఉపయోగించి గణాంకపరంగా విశ్లేషించారు మరియు స్టూడెంట్స్ టి పరీక్షను ఉపయోగించి గణనీయమైన తేడాలను నిర్ధారించారు. నమూనా పరిమాణాన్ని ప్రాథమికంగా నిర్ధారించడానికి ఎటువంటి గణాంక పద్ధతులను ఉపయోగించలేదు. విశ్లేషణ నుండి ఏ డేటానూ మినహాయించలేదు; ప్రయోగం యాదృచ్ఛికం చేయబడలేదు; ప్రయోగం సమయంలో మరియు ఫలితాల మూల్యాంకనం సమయంలో డేటా పంపిణీ గురించి పరిశోధకులకు తెలియకుండా లేదు. నమూనా పరిమాణం చిత్ర వివరణ మరియు మూల డేటా ఫైల్‌లో సూచించబడింది.
అధ్యయన రూపకల్పన గురించి మరింత సమాచారం కోసం, ఈ వ్యాసానికి సంబంధించిన నేచురల్ పోర్ట్‌ఫోలియో రిపోర్ట్ అబ్‌స్ట్రాక్ట్‌ను చూడండి.
మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ ప్రోటియోమిక్స్ డేటాను, PRIDE66 భాగస్వామ్య రిపోజిటరీ ద్వారా, PXD046004 అనే డేటాసెట్ ఐడెంటిఫైయర్‌తో ప్రోటియోమ్‌ఎక్స్‌ఛేంజ్ కన్సార్టియమ్‌కు అందించడం జరిగింది. ఈ అధ్యయనంలో పొందిన మిగతా డేటా అంతా సప్లిమెంటరీ ఇన్ఫర్మేషన్, సప్లిమెంటరీ డేటా ఫైల్స్, మరియు రా డేటా ఫైల్స్‌లో పొందుపరచబడింది. ఈ వ్యాసం కోసం మూల డేటా అందించబడింది.