విచారణ

క్రోమాటిన్‌తో హిస్టోన్ H2A అనుబంధాన్ని ప్రోత్సహించడం ద్వారా అరబిడోప్సిస్‌లో ఫాస్ఫోరైలేషన్ మాస్టర్ గ్రోత్ రెగ్యులేటర్ DELLAని సక్రియం చేస్తుంది.

డెల్లా ప్రోటీన్లు సంరక్షించబడిన మాస్టర్వృద్ధి నియంత్రకాలుఅంతర్గత మరియు పర్యావరణ సంకేతాలకు ప్రతిస్పందనగా మొక్కల అభివృద్ధిని నియంత్రించడంలో ఇవి కీలక పాత్ర పోషిస్తాయి. DELLA ట్రాన్స్క్రిప్షనల్ రెగ్యులేటర్‌గా పనిచేస్తుంది మరియు దాని GRAS డొమైన్ ద్వారా ట్రాన్స్క్రిప్షన్ కారకాలు (TFలు) మరియు హిస్టోన్ H2A లకు బంధించడం ద్వారా లక్ష్య ప్రమోటర్లకు నియమించబడుతుంది. ఇటీవలి అధ్యయనాలు DELLA స్థిరత్వం రెండు విధానాల ద్వారా అనువాదానంతరం నియంత్రించబడుతుందని చూపించాయి: ఫైటోహార్మోన్ గిబ్బరెల్లిన్ ద్వారా ప్రేరేపించబడిన పాలీయుబిక్విటినేషన్, ఇది దాని వేగవంతమైన క్షీణతకు దారితీస్తుంది మరియు దాని సంచితాన్ని పెంచడానికి చిన్న యుబిక్విటిన్-లాంటి మాడిఫైయర్‌ల (SUMO) సంయోగం. అదనంగా, DELLA కార్యాచరణ రెండు వేర్వేరు గ్లైకోసైలేషన్‌ల ద్వారా డైనమిక్‌గా నియంత్రించబడుతుంది: DELLA-TF పరస్పర చర్య O-ఫ్యూకోసైలేషన్ ద్వారా మెరుగుపరచబడుతుంది కానీ O-లింక్డ్ N-ఎసిటైల్గ్లూకోసమైన్ (O-GlcNAc) మార్పు ద్వారా నిరోధించబడుతుంది. అయితే, DELLA ఫాస్ఫోరైలేషన్ పాత్ర అస్పష్టంగానే ఉంది, ఎందుకంటే మునుపటి అధ్యయనాలు విరుద్ధమైన ఫలితాలను చూపించాయి, ఫాస్ఫోరైలేషన్ DELLA క్షీణతను ప్రోత్సహిస్తుందని లేదా తగ్గిస్తుందని చూపించే వాటి నుండి ఫాస్ఫోరైలేషన్ దాని స్థిరత్వాన్ని ప్రభావితం చేయదని చూపించే ఇతరుల వరకు. ఇక్కడ, మేము REPRESSORలో ఫాస్ఫోరైలేషన్ సైట్‌లను గుర్తిస్తాము.గా1-3(RGA, AtDELLA) మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ విశ్లేషణ ద్వారా అరబిడోప్సిస్ థాలియానా నుండి శుద్ధి చేయబడింది మరియు PolyS మరియు PolyS/T ప్రాంతాలలో రెండు RGA పెప్టైడ్‌ల ఫాస్ఫోరైలేషన్ H2A బైండింగ్‌ను ప్రోత్సహిస్తుందని మరియు RGA కార్యాచరణను మెరుగుపరుస్తుందని చూపిస్తుంది. లక్ష్య ప్రమోటర్‌లతో RGA అనుబంధం. ముఖ్యంగా, ఫాస్ఫోరైలేషన్ RGA-TF పరస్పర చర్యలను లేదా RGA స్థిరత్వాన్ని ప్రభావితం చేయదు. ఫాస్ఫోరైలేషన్ DELLA కార్యాచరణను ప్రేరేపించే పరమాణు యంత్రాంగాన్ని మా అధ్యయనం వెల్లడిస్తుంది.
DELLA ఫంక్షన్‌ను నియంత్రించడంలో ఫాస్ఫోరైలేషన్ పాత్రను విశదీకరించడానికి, DELLA ఫాస్ఫోరైలేషన్ సైట్‌లను ఇన్ వివోలో గుర్తించడం మరియు మొక్కలలో క్రియాత్మక విశ్లేషణలను నిర్వహించడం చాలా కీలకం. MS/MS విశ్లేషణ తర్వాత మొక్కల సారం యొక్క అనుబంధ శుద్దీకరణ ద్వారా, మేము RGAలో అనేక ఫాస్ఫోసైట్‌లను గుర్తించాము. GA లోపం ఉన్న పరిస్థితులలో, RHA ఫాస్ఫోరైలేషన్ పెరుగుతుంది, కానీ ఫాస్ఫోరైలేషన్ దాని స్థిరత్వాన్ని ప్రభావితం చేయదు. ముఖ్యంగా, సహ-IP మరియు ChIP-qPCR పరీక్షలు RGA యొక్క PolyS/T ప్రాంతంలో ఫాస్ఫోరైలేషన్ H2Aతో దాని పరస్పర చర్యను మరియు లక్ష్య ప్రమోటర్‌లతో దాని అనుబంధాన్ని ప్రోత్సహిస్తుందని, ఫాస్ఫోరైలేషన్ RGA ఫంక్షన్‌ను ప్రేరేపించే విధానాన్ని వెల్లడిస్తుందని వెల్లడించాయి.
LHR1 సబ్‌డొమైన్ TF తో పరస్పర చర్య ద్వారా క్రోమాటిన్‌ను లక్ష్యంగా చేసుకోవడానికి RGA ని నియమించుకుంటారు మరియు తరువాత దాని PolyS/T ప్రాంతం మరియు PFYRE సబ్‌డొమైన్ ద్వారా H2A కి బంధిస్తారు, RGA ని స్థిరీకరించడానికి H2A-RGA-TF కాంప్లెక్స్‌ను ఏర్పరుస్తారు. గుర్తించబడని కినేస్ ద్వారా DELLA డొమైన్ మరియు GRAS డొమైన్ మధ్య PolyS/T ప్రాంతంలో Pep 2 యొక్క ఫాస్ఫోరైలేషన్ RGA-H2A బైండింగ్‌ను పెంచుతుంది. rgam2A మ్యూటెంట్ ప్రోటీన్ RGA ఫాస్ఫోరైలేషన్‌ను రద్దు చేస్తుంది మరియు H2A బైండింగ్‌లో జోక్యం చేసుకోవడానికి వేరే ప్రోటీన్ కన్ఫర్మేషన్‌ను స్వీకరిస్తుంది. దీని ఫలితంగా తాత్కాలిక TF-rgam2A పరస్పర చర్యలు అస్థిరమవుతాయి మరియు లక్ష్య క్రోమాటిన్ నుండి rgam2A యొక్క విచ్ఛేదనం జరుగుతుంది. ఈ సంఖ్య RGA-మధ్యవర్తిత్వ ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ అణచివేతను మాత్రమే వర్ణిస్తుంది. H2A-RGA-TF కాంప్లెక్స్ లక్ష్య జన్యు ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్‌ను ప్రోత్సహిస్తుంది మరియు rgam2A యొక్క డీఫాస్ఫోరైలేషన్ ట్రాన్స్‌క్రిప్షన్‌ను తగ్గిస్తుంది తప్ప, RGA-మధ్యవర్తిత్వ ట్రాన్స్‌క్రిప్షనల్ యాక్టివేషన్ కోసం ఇలాంటి నమూనాను వివరించవచ్చు. హువాంగ్ మరియు ఇతరుల నుండి చిత్రం సవరించబడింది.21.
అన్ని పరిమాణాత్మక డేటాను ఎక్సెల్ ఉపయోగించి గణాంకపరంగా విశ్లేషించారు మరియు విద్యార్థుల టి పరీక్షను ఉపయోగించి ముఖ్యమైన తేడాలు నిర్ణయించబడ్డాయి. నమూనా పరిమాణాన్ని ప్రాథమికంగా నిర్ణయించడానికి ఎటువంటి గణాంక పద్ధతులు ఉపయోగించబడలేదు. విశ్లేషణ నుండి ఏ డేటాను మినహాయించలేదు; ప్రయోగం యాదృచ్ఛికంగా చేయబడలేదు; ప్రయోగం సమయంలో డేటా పంపిణీ మరియు ఫలితాల మూల్యాంకనం పట్ల పరిశోధకులు అంధులుగా లేరు. నమూనా పరిమాణం ఫిగర్ లెజెండ్ మరియు సోర్స్ డేటా ఫైల్‌లో సూచించబడింది.
అధ్యయన రూపకల్పన గురించి మరింత సమాచారం కోసం, ఈ వ్యాసంతో అనుబంధించబడిన నేచురల్ పోర్ట్‌ఫోలియో రిపోర్ట్ అబ్‌స్ట్రాక్ట్ చూడండి.
డేటాసెట్ ఐడెంటిఫైయర్ PXD046004 తో PRIDE66 భాగస్వామి రిపోజిటరీ ద్వారా మాస్ స్పెక్ట్రోమెట్రీ ప్రోటీమిక్స్ డేటాను ప్రోటీమ్ ఎక్స్ఛేంజ్ కన్సార్టియంకు అందించారు. ఈ అధ్యయనం సమయంలో పొందిన అన్ని ఇతర డేటా అనుబంధ సమాచారం, అనుబంధ డేటా ఫైల్స్ మరియు రా డేటా ఫైల్స్‌లో ప్రదర్శించబడింది. ఈ వ్యాసం కోసం మూల డేటా అందించబడింది.

 

పోస్ట్ సమయం: నవంబర్-08-2024